Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vamp7P70280 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms