Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms