Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn5P68500 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms