Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms