Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms