Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rps29P62274 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rps29P62274 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rps29P62274 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms