Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmc1P62192 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms