Protein–RNA interactions for Protein: P61294

Rab6b, Ras-related protein Rab-6B, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6bP61294 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab6bP61294 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6bP61294 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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