Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abce1P61222 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abce1P61222 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Abce1P61222 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abce1P61222 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abce1P61222 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abce1P61222 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abce1P61222 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms