Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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