Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap25P60879 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms