Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ActbP60710 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ActbP60710 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ActbP60710 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ActbP60710 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ActbP60710 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ActbP60710 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ActbP60710 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ActbP60710 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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