Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms