Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms