Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bace1P56818 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms