Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SmoP56726 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmoP56726 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmoP56726 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmoP56726 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmoP56726 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmoP56726 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmoP56726 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmoP56726 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmoP56726 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmoP56726 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmoP56726 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmoP56726 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmoP56726 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmoP56726 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmoP56726 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmoP56726 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmoP56726 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmoP56726 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmoP56726 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmoP56726 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmoP56726 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmoP56726 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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