Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TdgP56581 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TdgP56581 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TdgP56581 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TdgP56581 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TdgP56581 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TdgP56581 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TdgP56581 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TdgP56581 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TdgP56581 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms