Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms