Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp5eP56382 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms