Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtswP56203 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtswP56203 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CtswP56203 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtswP56203 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtswP56203 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtswP56203 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtswP56203 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtswP56203 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtswP56203 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtswP56203 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtswP56203 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtswP56203 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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