Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sh3bp1P55194 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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