Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms