Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pms2P54279 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pms2P54279 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pms2P54279 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pms2P54279 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pms2P54279 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pms2P54279 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms