Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PctpP53808 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PctpP53808 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PctpP53808 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PctpP53808 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PctpP53808 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PctpP53808 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PctpP53808 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PctpP53808 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PctpP53808 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PctpP53808 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PctpP53808 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PctpP53808 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PctpP53808 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PctpP53808 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PctpP53808 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PctpP53808 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PctpP53808 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PctpP53808 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PctpP53808 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PctpP53808 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PctpP53808 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PctpP53808 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PctpP53808 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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PctpP53808 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PctpP53808 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PctpP53808 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PctpP53808 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PctpP53808 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PctpP53808 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PctpP53808 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PctpP53808 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PctpP53808 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PctpP53808 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PctpP53808 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PctpP53808 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PctpP53808 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PctpP53808 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PctpP53808 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PctpP53808 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PctpP53808 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PctpP53808 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PctpP53808 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PctpP53808 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PctpP53808 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PctpP53808 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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