Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb41l4aP52963 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms