Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms