Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms