Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccr5P51682 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccr5P51682 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccr5P51682 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms