Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MipP51180 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MipP51180 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MipP51180 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MipP51180 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MipP51180 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MipP51180 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MipP51180 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MipP51180 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MipP51180 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MipP51180 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MipP51180 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MipP51180 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MipP51180 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MipP51180 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MipP51180 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MipP51180 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MipP51180 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MipP51180 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MipP51180 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MipP51180 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MipP51180 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MipP51180 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MipP51180 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MipP51180 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MipP51180 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MipP51180 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MipP51180 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MipP51180 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MipP51180 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MipP51180 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MipP51180 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MipP51180 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MipP51180 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MipP51180 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MipP51180 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MipP51180 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MipP51180 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MipP51180 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MipP51180 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MipP51180 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MipP51180 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MipP51180 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MipP51180 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MipP51180 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MipP51180 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MipP51180 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MipP51180 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MipP51180 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MipP51180 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MipP51180 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MipP51180 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MipP51180 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MipP51180 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MipP51180 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MipP51180 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MipP51180 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MipP51180 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MipP51180 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MipP51180 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms