Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FmodP50608 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FmodP50608 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FmodP50608 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms