Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx3P50481 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms