Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpbP50405 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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