Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtpreP49446 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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