Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gli1P47806 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gli1P47806 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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