Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrprbP47758 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms