Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdkn1bP46414 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms