Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms