Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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