Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ItgavP43406 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ItgavP43406 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ItgavP43406 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ItgavP43406 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms