Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtbP41155 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtbP41155 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtbP41155 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtbP41155 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtbP41155 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtbP41155 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtbP41155 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtbP41155 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtbP41155 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtbP41155 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LtbP41155 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LtbP41155 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LtbP41155 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LtbP41155 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbP41155 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbP41155 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbP41155 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbP41155 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbP41155 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbP41155 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbP41155 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbP41155 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbP41155 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbP41155 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbP41155 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbP41155 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbP41155 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbP41155 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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