Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VhlP40338 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VhlP40338 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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