Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps26aP40336 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps26aP40336 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vps26aP40336 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps26aP40336 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Vps26aP40336 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps26aP40336 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps26aP40336 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps26aP40336 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps26aP40336 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps26aP40336 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps26aP40336 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps26aP40336 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vps26aP40336 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vps26aP40336 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps26aP40336 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vps26aP40336 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vps26aP40336 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps26aP40336 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps26aP40336 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps26aP40336 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps26aP40336 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vps26aP40336 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps26aP40336 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps26aP40336 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps26aP40336 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vps26aP40336 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vps26aP40336 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vps26aP40336 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vps26aP40336 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps26aP40336 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps26aP40336 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms