Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fen1P39749 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fen1P39749 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms