Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprkP35822 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprkP35822 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprkP35822 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprkP35822 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprkP35822 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprkP35822 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprkP35822 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms