Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms