Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpardP35396 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpardP35396 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpardP35396 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpardP35396 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpardP35396 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpardP35396 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpardP35396 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpardP35396 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpardP35396 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpardP35396 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpardP35396 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpardP35396 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpardP35396 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms