Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab20P35295 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms