Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nedd1P33215 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms