Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hoxc11P31313 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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