Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms